Nagasaki, ken (prefektur), nordvestlige Kyushu, Japan, vendt mot Øst-Kinahavet. Det inkluderer øyene Tsushima, Iki og Hirado og de i Gotō-skjærgården. Byen Nagasaki er den prefekturelle hovedstaden.
Prefekturen har en uregelmessig form, med den avrundede Shimabara-halvøya, og lenger mot vest, den smale trekantede Nagasaki-halvøya - de to som avgrenser Tachibana-bukta - i sørøst. Shimabara Peninsula vaskes av Ariakehavet (nord og nordøst) og Shimabara Bay (øst og sørøst). Halvøya Nishisonoki (Nishisonogi) omslutter den nesten landlåste uraura-bukten langs prefekturets vestkyst nord for Nagasaki-byen. Prefekturets terreng er stort sett fjellaktig, og det begrensede jordbrukslandet dyrkes intenst med ris, søtpoteter og mandarin appelsiner. Fiskerisektoren gir flyt og kveite.
Kullgruvedrift - hovedsakelig på Ha- og Taka-øyene utenfor vestkysten av Nagasaki-halvøya - vokste i betydning fra slutten av 1800-tallet, men gruvedriften hadde opphørt i prefekturen på begynnelsen av det 21. århundre. Det er lite tungindustri bortsett fra skipsbygging i Nagasaki by og ved marinebasen i Sasebo. En annen stor by er Isahaya, som ligger mellom uramura Bay (vest) og Ariakehavet (øst). Nagasaki by har et universitet som ble grunnlagt i 1949. Område 1 092 kvadrat miles. Pop. (2010) 1 426 779.