John Rae, (født 30. september 1813, nær Stromness, Orknøyene, Skottland - døde 22. juli 1893, London), lege og oppdager i det kanadiske arktiske området.
Rae studerte medisin ved University of Edinburgh (1829–33). Han ble utnevnt (1833) til kirurg til Hudson's Bay Company-skipet som årlig besøkte Moose Factory, et handelssted på James Bay (nå i Ontario). To år senere ble han gjort til bosatt kirurg for stillingen, og han ble der i 10 år.
I 1846–47 satte Rae ut den første av fire ekspedisjoner til det kanadiske arktiske området; han undersøkte komité- og repulsbukta og beviste Boothia som en halvøy. Han kom tilbake til London, og ble utnevnt til nestkommanderende til Sir John Richardson på deres søk etter land (1848–49) mellom elvene Mackenzie og Coppermine for Sir John Franklins tapte arktiske ekspedisjon.
I 1849 plasserte Hudson's Bay Company Rae ansvarlig for Mackenzie River-distriktet. I åtte måneder i 1851 ledet han en annen part på leting etter Franklin, og reiste rundt 8 500 kilometer og kartla 700 mil fra den sørlige kysten av Victoria Island. Rae vendte tilbake til London, men i 1853–54 siktet han igjen til det kanadiske arktiske området, og undersøkte Boothia Peninsula og beviste kong William Land for å være en øy. Det var på denne reisen Rae mottok fra eskimoer i Pelly Bay den første nyheten om at medlemmene av Franklin-ekspedisjonen hadde omkommet av eksponering og sult.
Rae trakk seg fra Hudson's Bay Company i 1856 og bodde deretter hovedsakelig i London. I 1860 og 1864 deltok han i landundersøkelser for etablering av en telegraf mellom England og Amerika. Rae var kjent for sin evne til å leve av landet og for sin bemerkelsesverdige fysiske styrke; under sine arktiske reiser gikk han mer enn 23.000 mil. Han ble valgt til stipendiat i Royal Society i 1880. Hans forfattere inkluderer fortelling om en ekspedisjon til bredden av det arktiske hav, i 1846 og 1847 (1850).
