Biogeokjemi, studiet av oppførselen til uorganiske kjemiske elementer i biologiske systemer med geologisk omfang i motsetning til organisk geokjemi, som er studiet av de organiske forbindelsene som finnes i geologiske materialer og meteoritter, inkludert de med problematisk biologisk opprinnelse. Temaer som er klassifisert innen biogeokjemi og organisk geokjemi inkluderer opprinnelsen til petroleum, livets opprinnelse, sammensetningen av primitive atmosfærer, biogeokjemisk leting etter mineralforekomster, opprinnelsen til visse malmforekomster, kjemien til naturlige farvann, jorddannelse og kjemien av kull. Nesten alle geologiske prosesser som skjer på jordoverflaten påvirkes av biologisk aktivitet.
