Polychaete-hypotese, teori om at conodonts (små tannlignende strukturer funnet som fossiler i marine bergarter) er deler av kjeppeapparatet til polychaete ormer, en klasse av annelid eller segmenterte ormer. Conodonts ligner kjever (scolecodonts) av polychaete ormer i form, og de finnes i venstre og høyre par, så vel som scolecodonts. Polychaete-tenner er kjent så tidlig som i ordovicium-perioden (for ca. 505 millioner til 438 millioner år siden), men conodonts har sin første ubestridte forekomst tidligere, i den sene kambriske epoken (for rundt 523 millioner til 505 millioner år siden). Argumenter mot forholdet conodont – polychaete inkluderer det faktum at scolecodonts endrer seg lite med tiden, mens conodonts viser stor variasjon og evolusjon over tid. Scolecodonts består av kitin, et motstandsdyktig, kåt materiale som ligner på neglene i sammensetningen. Conodonts er imidlertid sammensatt av kalsiumfosfat, som i skjelettene til virveldyr. Noen ukjente grupper med polychaetes kan ha vært i stand til å utskille strukturer av kalsiumfosfat, men de store forskjellene i vekstmåte mellom conodonts og polychaete kjever utgjør et overbevisende argument mot polychaete hypotesen.
