Arieh Warshel, (født 20. november 1940, Kibbutz Sde-Nahum, Palestina [senere Israel]), amerikansk israelsk kjemiker som ble tildelt 2013 Nobelprisen for kjemi for å utvikle nøyaktige datamodeller av kjemiske reaksjoner som var i stand til å bruke funksjoner fra begge klassisk fysikk og kvantemekanikk. Han delte prisen med den amerikanske østerrikske kjemikeren Martin Karplus og den amerikanske britiske israelske kjemikeren Michael Levitt.
Warshel mottok en bachelorgrad (1966) i kjemi fra Technion – Israel Institute of Technology i Haifa og en mastergrad (1967) og en doktorgrad (1969) i kjemisk fysikk fra Weizmann Institute of Science i Reḥovot, Israel. Han var stipendiat (1970–72) ved Harvard University i Cambridge, Massachusetts. Han vendte tilbake til Weizmann Institute i 1972 som forskningsassistent og dro der i 1978 som lektor. Fra 1974 til 1976 var han besøkende vitenskapsmann ved Medical Research Council (MRC) Laboratory of Molecular Biology i Cambridge, England. I 1976 ble han førsteamanuensis i kjemi ved University of South California i Los Angeles. Han ble professor der i 1984 og en utmerket professor i 2011.
I løpet av tiden på grunnskolen hadde Warshel jobbet med Levitt på datamodellering av molekyler ved bruk av klassisk fysikk. I 1970 begynte han i Karplus som postdoktor ved Harvard. Karplus hadde allerede jobbet med dataprogrammer som brukte kvantemekanikk i modellering av kjemiske reaksjoner. De skrev et program som modellerte atomkjernene og noen elektroner i et molekyl ved bruk av klassisk fysikk og andre elektroner ved bruk av kvantemekanikk. Teknikken deres var opprinnelig begrenset til molekyler med speilsymmetri. Imidlertid var Karplus spesielt interessert i å modellere retinal, et stort komplekst molekyl, funnet i øyet og avgjørende for synet, som endrer form når det ble utsatt for lys. I 1974 modellerte Warshel, Karplus og samarbeidspartnere vellykket retinalens formforandring. På den tiden hadde Warshel gjenforent seg med Levitt på Weizmann Institute og senere på MRC Laboratory. I 1975 publiserte de resultatene av en simulering av proteinfolding. De hadde lenge vært interessert i reaksjoner som involverte enzymer, og de konstruerte et skjema der de sto for samspillet mellom de delene av enzymet som ble modellert klassisk og de som ble modellert kvantemekanisk. De måtte også redegjøre for interaksjonen mellom begge deler og det omkringliggende mediet. I 1976 brukte de sitt generelle opplegg til den første datamodellen for en enzymatisk reaksjon. Mer betydelig kan deres skjema brukes til å modellere ethvert molekyl.
